Dada la amplia aceptación que tuvo el curso Bioinformática realizado por el Servicio de Informática y Genómica del COMAV: Introducción al análisis de secuencias, se va a realizar una nueva edición del mismo. Por otro lado, el curso en esta edición se ha fragmentado en dos, ya que la parte de NGS cada vez requiere una mayor dedicación. Los cursos que se ofertarán serán: “Bioinformática básica” e “Introducción al análisis de secuencias NGS”. En el primero se estudiará el análisis de secuencias a pequeña escala mientras que en segundo contemplará el análisis de secuencias provenientes de distintas plataformas NGS. Los cursos son eminentemente prácticos y en esta edición hemos optado por un formato intensivo para facilitar la participación de alumnos de fuera de Valencia.
Bioinformática básica
1-Introducción.
2-Manejo de ficheros, secuencias y bases de datos.
3-Análisis de secuencias. Emboss.
4-Búsqueda y comparación con bases de datos. Blast.
5-Alineamiento múltiple.
6-Proyectos de secuenclación secuencias Sanger. Staden.
7-Anotación de secuencias.
8-Introducción al análisis de filogénias .
Los detalles relativos al curso se encuentran en el fichero adjunto o en la dirección: http://bioinf.comav.upv.es/courses.html
Introducción al análisis de secuencias NGS
1-Tecnologías de secuenciación
2- Alineamiento de secuencias
3- Ensamblaje secuencias NGS
4- Mapeo de secuencias NGS
5- Identificación de SNVs
6- Anotación de secuencias
7- RNA-seq
8- Manejo de grandes ficheros de datos
Se recomienda que se posean conocimientos básicos en bioinformática a nivel usuario: Alinear secuencias, comparar secuencias en las bases de datos, etc. En caso contrario se recomienda realizar el curso Introducción a la bioinformática.
Los detalles relativos al curso se encuentran en la dirección: http://bioinf.comav.upv.es/courses.html